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药学部是集药品供应管理、药品质量控制、合理用药指导及科研教学为一体的综合性药学技术服务部门。下设药品采供组、门诊药房、住院药房、中药房和临床药学室5个部门。担负医院药品供应、调剂、临床药学、药事管理等业务技术工作。在门诊药房、住院药房和中药房均设有药品咨询窗口,并且在中药房设煎药室为病人代煎中药。2013年创刊了《药讯》内部刊物,每季度出版1期。2019年10月成功创建为国家药物临床试验机构。